หลักสูตรระดับปริญญาเอก มีจำนวน 9 หลักสูตร ได้แก่
| ลำดับ | ชื่อหลักสูตร | ตัวย่อ | ภาษาที่ใช้ในหลักสูตร | เอกสารหลักสูตร |
| 1. | หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาฟิสิกส์ประยุกต์ |
DAP |
ภาษาไทย |
|
| 2. | หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาสถิติประยุกต์ |
DAST |
ภาษาไทย |
|
| 3. | หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาสถิติประยุกต์ (ภาคภาษาอังกฤษ) | E-DAST | ภาษาอังกฤษ | ดาวน์โหลด |
| 4. | หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีอุตสาหกรรมชีวภาพ | DBIT | ภาษาไทย | ดาวน์โหลด |
| 5. | หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีชีวภาพ |
DBT |
ภาษาไทย |
|
| 6. | หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาวิทยาการคอมพิวเตอร์ |
DCS |
ภาษาไทย |
|
| 7. | หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีและการจัดการสิ่งแวดล้อม |
DENVTM |
ภาษาไทย |
|
| 8. | หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาเคมีอุตสาหกรรม๒ |
DIC |
ภาษาไทย |
|
| 9. | หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาคณิตศาสตร์ประยุกต์ (ภาคภาษาอังกฤษ) |
E-DMA |
ภาษาอังกฤษ |
