หลักสูตรระดับปริญญาโท มีจำนวน 12 หลักสูตร ได้แก่

#	ชื่อหลักสูตร	ตัวย่อ	ภาษาที่ใช้ในหลักสูตร	เอกสารหลักสูตร
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาฟิสิกส์ประยุกต์	MAP	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาสถิติประยุกต์	MAST	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีอุตสาหกรรมชีวภาพ	MBIT	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีชีวภาพ	MBT	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาวิทยาการคอมพิวเตอร์	MCS	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาเทคโนโลยีและการจัดการสิ่งแวดล้อม	MENVTM	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีทางอาหาร	MFT	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาเคมีอุตสาหกรรม	MIC	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาคณิตศาสตร์ประยุกต์	MMA	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาคณิตศาสตร์เชิงวิทยาการคอมพิวเตอร์	MMC	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาอุปกรณ์การแพทย์	MMI	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด
	หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาวิศวกรรมซอฟต์แวร์ *งดรับนักศึกษาใหม่ในปีการศึกษา 2563 - 2565	MSE	ภาษาไทย	ดาวน์โหลด